Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt78E9Q0F0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt78E9Q0F0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt78E9Q0F0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt78E9Q0F0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt78E9Q0F0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt78E9Q0F0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt78E9Q0F0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt78E9Q0F0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt78E9Q0F0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt78E9Q0F0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt78E9Q0F0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt78E9Q0F0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt78E9Q0F0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt78E9Q0F0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt78E9Q0F0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt78E9Q0F0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt78E9Q0F0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt78E9Q0F0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt78E9Q0F0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt78E9Q0F0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt78E9Q0F0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt78E9Q0F0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt78E9Q0F0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt78E9Q0F0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt78E9Q0F0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt78E9Q0F0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt78E9Q0F0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt78E9Q0F0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt78E9Q0F0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt78E9Q0F0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt78E9Q0F0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt78E9Q0F0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt78E9Q0F0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt78E9Q0F0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt78E9Q0F0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt78E9Q0F0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt78E9Q0F0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt78E9Q0F0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt78E9Q0F0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt78E9Q0F0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt78E9Q0F0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt78E9Q0F0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt78E9Q0F0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt78E9Q0F0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt78E9Q0F0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt78E9Q0F0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt78E9Q0F0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt78E9Q0F0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt78E9Q0F0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt78E9Q0F0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt78E9Q0F0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt78E9Q0F0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt78E9Q0F0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt78E9Q0F0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt78E9Q0F0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt78E9Q0F0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt78E9Q0F0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt78E9Q0F0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt78E9Q0F0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt78E9Q0F0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt78E9Q0F0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt78E9Q0F0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt78E9Q0F0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt78E9Q0F0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt78E9Q0F0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt78E9Q0F0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt78E9Q0F0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt78E9Q0F0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt78E9Q0F0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt78E9Q0F0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt78E9Q0F0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt78E9Q0F0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt78E9Q0F0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt78E9Q0F0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt78E9Q0F0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt78E9Q0F0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt78E9Q0F0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt78E9Q0F0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt78E9Q0F0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Krt78E9Q0F0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt78E9Q0F0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt78E9Q0F0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt78E9Q0F0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt78E9Q0F0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt78E9Q0F0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt78E9Q0F0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt78E9Q0F0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt78E9Q0F0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt78E9Q0F0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt78E9Q0F0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt78E9Q0F0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt78E9Q0F0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt78E9Q0F0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt78E9Q0F0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt78E9Q0F0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt78E9Q0F0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt78E9Q0F0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt78E9Q0F0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt78E9Q0F0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms