Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ8

E430018J23Rik, RIKEN cDNA E430018J23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E430018J23RikE9PZQ8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E430018J23RikE9PZQ8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
E430018J23RikE9PZQ8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E430018J23RikE9PZQ8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E430018J23RikE9PZQ8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E430018J23RikE9PZQ8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E430018J23RikE9PZQ8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E430018J23RikE9PZQ8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E430018J23RikE9PZQ8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E430018J23RikE9PZQ8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E430018J23RikE9PZQ8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E430018J23RikE9PZQ8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E430018J23RikE9PZQ8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E430018J23RikE9PZQ8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
E430018J23RikE9PZQ8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
E430018J23RikE9PZQ8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E430018J23RikE9PZQ8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E430018J23RikE9PZQ8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E430018J23RikE9PZQ8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E430018J23RikE9PZQ8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E430018J23RikE9PZQ8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E430018J23RikE9PZQ8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E430018J23RikE9PZQ8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
E430018J23RikE9PZQ8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E430018J23RikE9PZQ8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E430018J23RikE9PZQ8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E430018J23RikE9PZQ8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
E430018J23RikE9PZQ8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E430018J23RikE9PZQ8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17■□□□□ 0.31
E430018J23RikE9PZQ8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
E430018J23RikE9PZQ8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E430018J23RikE9PZQ8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E430018J23RikE9PZQ8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E430018J23RikE9PZQ8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E430018J23RikE9PZQ8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
E430018J23RikE9PZQ8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E430018J23RikE9PZQ8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E430018J23RikE9PZQ8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E430018J23RikE9PZQ8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E430018J23RikE9PZQ8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E430018J23RikE9PZQ8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
E430018J23RikE9PZQ8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E430018J23RikE9PZQ8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E430018J23RikE9PZQ8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E430018J23RikE9PZQ8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E430018J23RikE9PZQ8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E430018J23RikE9PZQ8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E430018J23RikE9PZQ8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E430018J23RikE9PZQ8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E430018J23RikE9PZQ8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E430018J23RikE9PZQ8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
E430018J23RikE9PZQ8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E430018J23RikE9PZQ8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E430018J23RikE9PZQ8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E430018J23RikE9PZQ8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E430018J23RikE9PZQ8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E430018J23RikE9PZQ8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E430018J23RikE9PZQ8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E430018J23RikE9PZQ8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E430018J23RikE9PZQ8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E430018J23RikE9PZQ8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E430018J23RikE9PZQ8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E430018J23RikE9PZQ8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E430018J23RikE9PZQ8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E430018J23RikE9PZQ8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E430018J23RikE9PZQ8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E430018J23RikE9PZQ8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E430018J23RikE9PZQ8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E430018J23RikE9PZQ8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E430018J23RikE9PZQ8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
E430018J23RikE9PZQ8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E430018J23RikE9PZQ8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E430018J23RikE9PZQ8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E430018J23RikE9PZQ8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E430018J23RikE9PZQ8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E430018J23RikE9PZQ8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E430018J23RikE9PZQ8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E430018J23RikE9PZQ8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E430018J23RikE9PZQ8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E430018J23RikE9PZQ8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E430018J23RikE9PZQ8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E430018J23RikE9PZQ8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E430018J23RikE9PZQ8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E430018J23RikE9PZQ8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E430018J23RikE9PZQ8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E430018J23RikE9PZQ8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E430018J23RikE9PZQ8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E430018J23RikE9PZQ8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E430018J23RikE9PZQ8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E430018J23RikE9PZQ8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E430018J23RikE9PZQ8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E430018J23RikE9PZQ8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E430018J23RikE9PZQ8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E430018J23RikE9PZQ8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E430018J23RikE9PZQ8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E430018J23RikE9PZQ8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E430018J23RikE9PZQ8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E430018J23RikE9PZQ8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E430018J23RikE9PZQ8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E430018J23RikE9PZQ8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms