Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ddx60E9PZQ1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Ddx60E9PZQ1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ddx60E9PZQ1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ddx60E9PZQ1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ddx60E9PZQ1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ddx60E9PZQ1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ddx60E9PZQ1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ddx60E9PZQ1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Ddx60E9PZQ1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ddx60E9PZQ1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ddx60E9PZQ1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ddx60E9PZQ1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ddx60E9PZQ1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ddx60E9PZQ1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ddx60E9PZQ1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ddx60E9PZQ1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ddx60E9PZQ1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ddx60E9PZQ1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ddx60E9PZQ1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ddx60E9PZQ1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ddx60E9PZQ1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ddx60E9PZQ1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ddx60E9PZQ1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ddx60E9PZQ1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ddx60E9PZQ1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ddx60E9PZQ1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ddx60E9PZQ1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ddx60E9PZQ1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Ddx60E9PZQ1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ddx60E9PZQ1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ddx60E9PZQ1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ddx60E9PZQ1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ddx60E9PZQ1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ddx60E9PZQ1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ddx60E9PZQ1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Ddx60E9PZQ1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ddx60E9PZQ1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ddx60E9PZQ1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ddx60E9PZQ1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ddx60E9PZQ1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ddx60E9PZQ1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ddx60E9PZQ1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ddx60E9PZQ1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ddx60E9PZQ1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ddx60E9PZQ1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ddx60E9PZQ1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ddx60E9PZQ1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ddx60E9PZQ1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ddx60E9PZQ1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ddx60E9PZQ1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ddx60E9PZQ1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ddx60E9PZQ1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ddx60E9PZQ1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ddx60E9PZQ1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ddx60E9PZQ1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ddx60E9PZQ1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ddx60E9PZQ1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Ddx60E9PZQ1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ddx60E9PZQ1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ddx60E9PZQ1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ddx60E9PZQ1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ddx60E9PZQ1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ddx60E9PZQ1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ddx60E9PZQ1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ddx60E9PZQ1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ddx60E9PZQ1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ddx60E9PZQ1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ddx60E9PZQ1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ddx60E9PZQ1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Ddx60E9PZQ1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ddx60E9PZQ1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ddx60E9PZQ1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ddx60E9PZQ1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ddx60E9PZQ1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ddx60E9PZQ1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ddx60E9PZQ1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ddx60E9PZQ1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ddx60E9PZQ1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ddx60E9PZQ1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ddx60E9PZQ1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Ddx60E9PZQ1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ddx60E9PZQ1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ddx60E9PZQ1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ddx60E9PZQ1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ddx60E9PZQ1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ddx60E9PZQ1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ddx60E9PZQ1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ddx60E9PZQ1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ddx60E9PZQ1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ddx60E9PZQ1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ddx60E9PZQ1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ddx60E9PZQ1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ddx60E9PZQ1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ddx60E9PZQ1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ddx60E9PZQ1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ddx60E9PZQ1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ddx60E9PZQ1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ddx60E9PZQ1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ddx60E9PZQ1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
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