Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rsph10bE9PYQ0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rsph10bE9PYQ0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rsph10bE9PYQ0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rsph10bE9PYQ0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rsph10bE9PYQ0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rsph10bE9PYQ0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rsph10bE9PYQ0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rsph10bE9PYQ0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rsph10bE9PYQ0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rsph10bE9PYQ0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rsph10bE9PYQ0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rsph10bE9PYQ0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rsph10bE9PYQ0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rsph10bE9PYQ0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rsph10bE9PYQ0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rsph10bE9PYQ0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rsph10bE9PYQ0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rsph10bE9PYQ0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rsph10bE9PYQ0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rsph10bE9PYQ0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rsph10bE9PYQ0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rsph10bE9PYQ0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rsph10bE9PYQ0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rsph10bE9PYQ0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Rsph10bE9PYQ0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rsph10bE9PYQ0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rsph10bE9PYQ0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rsph10bE9PYQ0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rsph10bE9PYQ0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rsph10bE9PYQ0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rsph10bE9PYQ0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rsph10bE9PYQ0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rsph10bE9PYQ0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rsph10bE9PYQ0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rsph10bE9PYQ0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rsph10bE9PYQ0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rsph10bE9PYQ0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rsph10bE9PYQ0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rsph10bE9PYQ0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rsph10bE9PYQ0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rsph10bE9PYQ0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rsph10bE9PYQ0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rsph10bE9PYQ0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rsph10bE9PYQ0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rsph10bE9PYQ0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rsph10bE9PYQ0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rsph10bE9PYQ0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rsph10bE9PYQ0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rsph10bE9PYQ0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rsph10bE9PYQ0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rsph10bE9PYQ0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rsph10bE9PYQ0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rsph10bE9PYQ0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rsph10bE9PYQ0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rsph10bE9PYQ0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rsph10bE9PYQ0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rsph10bE9PYQ0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rsph10bE9PYQ0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rsph10bE9PYQ0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rsph10bE9PYQ0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rsph10bE9PYQ0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rsph10bE9PYQ0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rsph10bE9PYQ0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rsph10bE9PYQ0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rsph10bE9PYQ0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rsph10bE9PYQ0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rsph10bE9PYQ0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rsph10bE9PYQ0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rsph10bE9PYQ0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rsph10bE9PYQ0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rsph10bE9PYQ0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rsph10bE9PYQ0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Rsph10bE9PYQ0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rsph10bE9PYQ0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rsph10bE9PYQ0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rsph10bE9PYQ0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rsph10bE9PYQ0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rsph10bE9PYQ0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rsph10bE9PYQ0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rsph10bE9PYQ0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rsph10bE9PYQ0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rsph10bE9PYQ0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rsph10bE9PYQ0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Rsph10bE9PYQ0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rsph10bE9PYQ0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rsph10bE9PYQ0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rsph10bE9PYQ0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rsph10bE9PYQ0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rsph10bE9PYQ0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rsph10bE9PYQ0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rsph10bE9PYQ0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rsph10bE9PYQ0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rsph10bE9PYQ0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rsph10bE9PYQ0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rsph10bE9PYQ0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rsph10bE9PYQ0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rsph10bE9PYQ0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rsph10bE9PYQ0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms