Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3002E9PW72 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3002E9PW72 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3002E9PW72 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3002E9PW72 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3002E9PW72 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3002E9PW72 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3002E9PW72 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3002E9PW72 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3002E9PW72 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3002E9PW72 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3002E9PW72 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3002E9PW72 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3002E9PW72 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3002E9PW72 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3002E9PW72 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3002E9PW72 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3002E9PW72 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3002E9PW72 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3002E9PW72 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3002E9PW72 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3002E9PW72 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3002E9PW72 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3002E9PW72 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3002E9PW72 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3002E9PW72 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3002E9PW72 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3002E9PW72 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3002E9PW72 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3002E9PW72 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3002E9PW72 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3002E9PW72 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3002E9PW72 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3002E9PW72 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3002E9PW72 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3002E9PW72 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3002E9PW72 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3002E9PW72 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3002E9PW72 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3002E9PW72 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3002E9PW72 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3002E9PW72 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3002E9PW72 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3002E9PW72 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3002E9PW72 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3002E9PW72 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3002E9PW72 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3002E9PW72 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3002E9PW72 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3002E9PW72 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3002E9PW72 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3002E9PW72 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3002E9PW72 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3002E9PW72 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3002E9PW72 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3002E9PW72 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3002E9PW72 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3002E9PW72 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3002E9PW72 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3002E9PW72 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3002E9PW72 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3002E9PW72 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3002E9PW72 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3002E9PW72 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3002E9PW72 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3002E9PW72 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3002E9PW72 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3002E9PW72 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3002E9PW72 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3002E9PW72 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3002E9PW72 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3002E9PW72 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3002E9PW72 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3002E9PW72 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3002E9PW72 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3002E9PW72 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3002E9PW72 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3002E9PW72 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3002E9PW72 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3002E9PW72 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3002E9PW72 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3002E9PW72 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3002E9PW72 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3002E9PW72 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3002E9PW72 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3002E9PW72 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3002E9PW72 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3002E9PW72 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gm3002E9PW72 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gm3002E9PW72 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3002E9PW72 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3002E9PW72 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3002E9PW72 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3002E9PW72 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3002E9PW72 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3002E9PW72 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3002E9PW72 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3002E9PW72 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3002E9PW72 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3002E9PW72 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms