Protein–RNA interactions for Protein: E9PW10

Triml2, Tripartite motif family-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Triml2E9PW10 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Triml2E9PW10 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Triml2E9PW10 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Triml2E9PW10 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Triml2E9PW10 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Triml2E9PW10 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Triml2E9PW10 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Triml2E9PW10 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Triml2E9PW10 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Triml2E9PW10 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Triml2E9PW10 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Triml2E9PW10 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Triml2E9PW10 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Triml2E9PW10 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Triml2E9PW10 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Triml2E9PW10 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Triml2E9PW10 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Triml2E9PW10 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Triml2E9PW10 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Triml2E9PW10 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Triml2E9PW10 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Triml2E9PW10 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Triml2E9PW10 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Triml2E9PW10 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Triml2E9PW10 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Triml2E9PW10 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Triml2E9PW10 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Triml2E9PW10 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Triml2E9PW10 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Triml2E9PW10 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Triml2E9PW10 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Triml2E9PW10 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Triml2E9PW10 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Triml2E9PW10 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Triml2E9PW10 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Triml2E9PW10 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Triml2E9PW10 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Triml2E9PW10 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Triml2E9PW10 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Triml2E9PW10 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Triml2E9PW10 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Triml2E9PW10 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Triml2E9PW10 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Triml2E9PW10 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Triml2E9PW10 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Triml2E9PW10 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Triml2E9PW10 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Triml2E9PW10 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Triml2E9PW10 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Triml2E9PW10 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Triml2E9PW10 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Triml2E9PW10 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Triml2E9PW10 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Triml2E9PW10 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Triml2E9PW10 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Triml2E9PW10 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Triml2E9PW10 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Triml2E9PW10 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Triml2E9PW10 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Triml2E9PW10 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Triml2E9PW10 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Triml2E9PW10 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Triml2E9PW10 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Triml2E9PW10 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Triml2E9PW10 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Triml2E9PW10 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Triml2E9PW10 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Triml2E9PW10 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Triml2E9PW10 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Triml2E9PW10 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Triml2E9PW10 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Triml2E9PW10 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Triml2E9PW10 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Triml2E9PW10 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Triml2E9PW10 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Triml2E9PW10 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Triml2E9PW10 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Triml2E9PW10 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Triml2E9PW10 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Triml2E9PW10 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Triml2E9PW10 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Triml2E9PW10 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Triml2E9PW10 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Triml2E9PW10 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Triml2E9PW10 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Triml2E9PW10 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Triml2E9PW10 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Triml2E9PW10 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Triml2E9PW10 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Triml2E9PW10 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Triml2E9PW10 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Triml2E9PW10 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Triml2E9PW10 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Triml2E9PW10 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Triml2E9PW10 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Triml2E9PW10 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Triml2E9PW10 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Triml2E9PW10 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Triml2E9PW10 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Triml2E9PW10 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms