Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttc17E9PVB5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttc17E9PVB5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttc17E9PVB5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttc17E9PVB5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttc17E9PVB5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttc17E9PVB5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttc17E9PVB5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttc17E9PVB5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttc17E9PVB5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttc17E9PVB5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttc17E9PVB5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttc17E9PVB5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttc17E9PVB5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttc17E9PVB5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttc17E9PVB5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttc17E9PVB5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttc17E9PVB5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttc17E9PVB5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttc17E9PVB5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttc17E9PVB5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttc17E9PVB5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttc17E9PVB5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttc17E9PVB5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttc17E9PVB5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttc17E9PVB5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttc17E9PVB5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttc17E9PVB5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttc17E9PVB5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttc17E9PVB5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttc17E9PVB5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ttc17E9PVB5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ttc17E9PVB5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ttc17E9PVB5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ttc17E9PVB5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttc17E9PVB5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttc17E9PVB5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc17E9PVB5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc17E9PVB5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc17E9PVB5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc17E9PVB5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc17E9PVB5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc17E9PVB5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc17E9PVB5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc17E9PVB5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttc17E9PVB5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttc17E9PVB5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttc17E9PVB5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttc17E9PVB5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc17E9PVB5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc17E9PVB5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc17E9PVB5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc17E9PVB5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc17E9PVB5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc17E9PVB5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc17E9PVB5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc17E9PVB5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc17E9PVB5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc17E9PVB5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc17E9PVB5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc17E9PVB5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttc17E9PVB5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttc17E9PVB5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttc17E9PVB5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttc17E9PVB5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttc17E9PVB5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttc17E9PVB5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttc17E9PVB5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc17E9PVB5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc17E9PVB5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc17E9PVB5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc17E9PVB5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc17E9PVB5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc17E9PVB5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttc17E9PVB5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttc17E9PVB5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttc17E9PVB5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ttc17E9PVB5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ttc17E9PVB5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ttc17E9PVB5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ttc17E9PVB5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc17E9PVB5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc17E9PVB5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc17E9PVB5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc17E9PVB5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc17E9PVB5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc17E9PVB5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc17E9PVB5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc17E9PVB5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc17E9PVB5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc17E9PVB5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc17E9PVB5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc17E9PVB5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc17E9PVB5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc17E9PVB5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc17E9PVB5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc17E9PVB5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc17E9PVB5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc17E9PVB5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc17E9PVB5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms