Protein–RNA interactions for Protein: E9PV98

Trim5, Tripartite motif-containing 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim5E9PV98 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim5E9PV98 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim5E9PV98 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim5E9PV98 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim5E9PV98 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim5E9PV98 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim5E9PV98 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim5E9PV98 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim5E9PV98 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim5E9PV98 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trim5E9PV98 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim5E9PV98 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim5E9PV98 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim5E9PV98 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim5E9PV98 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim5E9PV98 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim5E9PV98 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim5E9PV98 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim5E9PV98 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim5E9PV98 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim5E9PV98 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim5E9PV98 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim5E9PV98 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim5E9PV98 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim5E9PV98 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim5E9PV98 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim5E9PV98 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim5E9PV98 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim5E9PV98 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim5E9PV98 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim5E9PV98 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim5E9PV98 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim5E9PV98 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim5E9PV98 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim5E9PV98 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim5E9PV98 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim5E9PV98 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim5E9PV98 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim5E9PV98 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim5E9PV98 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim5E9PV98 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim5E9PV98 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim5E9PV98 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim5E9PV98 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim5E9PV98 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim5E9PV98 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim5E9PV98 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim5E9PV98 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim5E9PV98 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim5E9PV98 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim5E9PV98 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim5E9PV98 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim5E9PV98 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim5E9PV98 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Trim5E9PV98 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim5E9PV98 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim5E9PV98 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim5E9PV98 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim5E9PV98 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim5E9PV98 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim5E9PV98 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim5E9PV98 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim5E9PV98 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim5E9PV98 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim5E9PV98 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim5E9PV98 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim5E9PV98 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim5E9PV98 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim5E9PV98 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim5E9PV98 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim5E9PV98 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim5E9PV98 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim5E9PV98 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim5E9PV98 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim5E9PV98 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim5E9PV98 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim5E9PV98 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim5E9PV98 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim5E9PV98 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim5E9PV98 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim5E9PV98 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim5E9PV98 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim5E9PV98 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim5E9PV98 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim5E9PV98 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim5E9PV98 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim5E9PV98 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim5E9PV98 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim5E9PV98 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim5E9PV98 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim5E9PV98 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim5E9PV98 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim5E9PV98 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim5E9PV98 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim5E9PV98 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim5E9PV98 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim5E9PV98 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim5E9PV98 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim5E9PV98 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim5E9PV98 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms