Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clca3bE9PUL3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clca3bE9PUL3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clca3bE9PUL3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Clca3bE9PUL3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clca3bE9PUL3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Clca3bE9PUL3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clca3bE9PUL3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clca3bE9PUL3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clca3bE9PUL3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clca3bE9PUL3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Clca3bE9PUL3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Clca3bE9PUL3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clca3bE9PUL3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clca3bE9PUL3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clca3bE9PUL3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clca3bE9PUL3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clca3bE9PUL3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clca3bE9PUL3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clca3bE9PUL3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clca3bE9PUL3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clca3bE9PUL3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clca3bE9PUL3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clca3bE9PUL3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clca3bE9PUL3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clca3bE9PUL3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clca3bE9PUL3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clca3bE9PUL3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clca3bE9PUL3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Clca3bE9PUL3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clca3bE9PUL3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clca3bE9PUL3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clca3bE9PUL3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clca3bE9PUL3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clca3bE9PUL3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clca3bE9PUL3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clca3bE9PUL3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clca3bE9PUL3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clca3bE9PUL3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Clca3bE9PUL3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clca3bE9PUL3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clca3bE9PUL3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clca3bE9PUL3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clca3bE9PUL3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clca3bE9PUL3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clca3bE9PUL3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clca3bE9PUL3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clca3bE9PUL3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clca3bE9PUL3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clca3bE9PUL3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clca3bE9PUL3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clca3bE9PUL3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clca3bE9PUL3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clca3bE9PUL3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clca3bE9PUL3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clca3bE9PUL3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clca3bE9PUL3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clca3bE9PUL3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clca3bE9PUL3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clca3bE9PUL3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clca3bE9PUL3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clca3bE9PUL3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clca3bE9PUL3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clca3bE9PUL3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clca3bE9PUL3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clca3bE9PUL3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clca3bE9PUL3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Clca3bE9PUL3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clca3bE9PUL3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clca3bE9PUL3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clca3bE9PUL3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clca3bE9PUL3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clca3bE9PUL3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clca3bE9PUL3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clca3bE9PUL3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clca3bE9PUL3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clca3bE9PUL3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clca3bE9PUL3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clca3bE9PUL3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clca3bE9PUL3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clca3bE9PUL3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clca3bE9PUL3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clca3bE9PUL3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Clca3bE9PUL3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clca3bE9PUL3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clca3bE9PUL3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clca3bE9PUL3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clca3bE9PUL3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clca3bE9PUL3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clca3bE9PUL3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clca3bE9PUL3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clca3bE9PUL3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clca3bE9PUL3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clca3bE9PUL3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clca3bE9PUL3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clca3bE9PUL3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clca3bE9PUL3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clca3bE9PUL3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Clca3bE9PUL3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Clca3bE9PUL3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms