Protein–RNA interactions for Protein: E0CXF8

BC035044, cDNA sequence BC035044, mousemouse

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035044E0CXF8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BC035044E0CXF8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BC035044E0CXF8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BC035044E0CXF8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BC035044E0CXF8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BC035044E0CXF8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BC035044E0CXF8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BC035044E0CXF8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BC035044E0CXF8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BC035044E0CXF8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
BC035044E0CXF8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BC035044E0CXF8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BC035044E0CXF8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BC035044E0CXF8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BC035044E0CXF8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BC035044E0CXF8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BC035044E0CXF8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BC035044E0CXF8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BC035044E0CXF8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BC035044E0CXF8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BC035044E0CXF8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BC035044E0CXF8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BC035044E0CXF8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BC035044E0CXF8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BC035044E0CXF8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BC035044E0CXF8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BC035044E0CXF8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BC035044E0CXF8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
BC035044E0CXF8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BC035044E0CXF8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BC035044E0CXF8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BC035044E0CXF8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BC035044E0CXF8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BC035044E0CXF8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BC035044E0CXF8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BC035044E0CXF8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BC035044E0CXF8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BC035044E0CXF8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BC035044E0CXF8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BC035044E0CXF8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BC035044E0CXF8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BC035044E0CXF8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BC035044E0CXF8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BC035044E0CXF8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BC035044E0CXF8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BC035044E0CXF8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BC035044E0CXF8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BC035044E0CXF8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BC035044E0CXF8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BC035044E0CXF8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BC035044E0CXF8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BC035044E0CXF8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BC035044E0CXF8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BC035044E0CXF8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BC035044E0CXF8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BC035044E0CXF8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BC035044E0CXF8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BC035044E0CXF8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BC035044E0CXF8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BC035044E0CXF8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BC035044E0CXF8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BC035044E0CXF8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BC035044E0CXF8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BC035044E0CXF8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BC035044E0CXF8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BC035044E0CXF8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BC035044E0CXF8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BC035044E0CXF8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BC035044E0CXF8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BC035044E0CXF8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BC035044E0CXF8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BC035044E0CXF8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BC035044E0CXF8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BC035044E0CXF8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BC035044E0CXF8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BC035044E0CXF8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BC035044E0CXF8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BC035044E0CXF8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BC035044E0CXF8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BC035044E0CXF8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BC035044E0CXF8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BC035044E0CXF8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BC035044E0CXF8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BC035044E0CXF8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BC035044E0CXF8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BC035044E0CXF8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BC035044E0CXF8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BC035044E0CXF8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BC035044E0CXF8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BC035044E0CXF8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BC035044E0CXF8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BC035044E0CXF8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BC035044E0CXF8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BC035044E0CXF8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BC035044E0CXF8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BC035044E0CXF8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BC035044E0CXF8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BC035044E0CXF8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BC035044E0CXF8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
BC035044E0CXF8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms