Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vpreb3D3Z6J4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vpreb3D3Z6J4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vpreb3D3Z6J4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vpreb3D3Z6J4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vpreb3D3Z6J4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vpreb3D3Z6J4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Vpreb3D3Z6J4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vpreb3D3Z6J4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vpreb3D3Z6J4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vpreb3D3Z6J4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vpreb3D3Z6J4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vpreb3D3Z6J4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vpreb3D3Z6J4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vpreb3D3Z6J4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vpreb3D3Z6J4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vpreb3D3Z6J4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vpreb3D3Z6J4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vpreb3D3Z6J4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vpreb3D3Z6J4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vpreb3D3Z6J4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vpreb3D3Z6J4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vpreb3D3Z6J4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vpreb3D3Z6J4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vpreb3D3Z6J4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vpreb3D3Z6J4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vpreb3D3Z6J4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vpreb3D3Z6J4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vpreb3D3Z6J4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vpreb3D3Z6J4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vpreb3D3Z6J4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vpreb3D3Z6J4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Vpreb3D3Z6J4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vpreb3D3Z6J4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vpreb3D3Z6J4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Vpreb3D3Z6J4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vpreb3D3Z6J4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vpreb3D3Z6J4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vpreb3D3Z6J4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Vpreb3D3Z6J4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Vpreb3D3Z6J4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Vpreb3D3Z6J4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms