Protein–RNA interactions for Protein: D3Z236

Gm3676, Predicted gene 3676, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3676D3Z236 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3676D3Z236 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3676D3Z236 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3676D3Z236 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3676D3Z236 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3676D3Z236 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3676D3Z236 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3676D3Z236 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3676D3Z236 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3676D3Z236 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3676D3Z236 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3676D3Z236 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3676D3Z236 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3676D3Z236 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3676D3Z236 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3676D3Z236 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3676D3Z236 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3676D3Z236 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3676D3Z236 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3676D3Z236 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3676D3Z236 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3676D3Z236 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3676D3Z236 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3676D3Z236 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3676D3Z236 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3676D3Z236 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3676D3Z236 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3676D3Z236 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3676D3Z236 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3676D3Z236 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3676D3Z236 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3676D3Z236 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3676D3Z236 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3676D3Z236 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3676D3Z236 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3676D3Z236 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3676D3Z236 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3676D3Z236 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3676D3Z236 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3676D3Z236 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3676D3Z236 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3676D3Z236 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3676D3Z236 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3676D3Z236 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3676D3Z236 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3676D3Z236 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3676D3Z236 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3676D3Z236 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gm3676D3Z236 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3676D3Z236 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3676D3Z236 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3676D3Z236 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3676D3Z236 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3676D3Z236 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3676D3Z236 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3676D3Z236 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3676D3Z236 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3676D3Z236 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3676D3Z236 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3676D3Z236 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3676D3Z236 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3676D3Z236 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3676D3Z236 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3676D3Z236 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3676D3Z236 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3676D3Z236 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3676D3Z236 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3676D3Z236 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3676D3Z236 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3676D3Z236 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3676D3Z236 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3676D3Z236 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3676D3Z236 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3676D3Z236 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3676D3Z236 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3676D3Z236 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3676D3Z236 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3676D3Z236 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3676D3Z236 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3676D3Z236 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3676D3Z236 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3676D3Z236 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3676D3Z236 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3676D3Z236 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3676D3Z236 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3676D3Z236 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3676D3Z236 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3676D3Z236 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3676D3Z236 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3676D3Z236 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3676D3Z236 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3676D3Z236 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3676D3Z236 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3676D3Z236 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3676D3Z236 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3676D3Z236 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3676D3Z236 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm3676D3Z236 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3676D3Z236 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3676D3Z236 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms