Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc170D3YXL0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc170D3YXL0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc170D3YXL0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc170D3YXL0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc170D3YXL0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc170D3YXL0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc170D3YXL0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc170D3YXL0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc170D3YXL0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc170D3YXL0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc170D3YXL0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc170D3YXL0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc170D3YXL0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc170D3YXL0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc170D3YXL0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc170D3YXL0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc170D3YXL0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc170D3YXL0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc170D3YXL0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc170D3YXL0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc170D3YXL0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc170D3YXL0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc170D3YXL0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc170D3YXL0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ccdc170D3YXL0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc170D3YXL0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc170D3YXL0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc170D3YXL0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc170D3YXL0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc170D3YXL0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc170D3YXL0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc170D3YXL0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc170D3YXL0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc170D3YXL0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc170D3YXL0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc170D3YXL0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc170D3YXL0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc170D3YXL0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc170D3YXL0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc170D3YXL0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc170D3YXL0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc170D3YXL0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc170D3YXL0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc170D3YXL0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc170D3YXL0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc170D3YXL0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc170D3YXL0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc170D3YXL0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc170D3YXL0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc170D3YXL0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc170D3YXL0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc170D3YXL0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc170D3YXL0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc170D3YXL0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc170D3YXL0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc170D3YXL0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc170D3YXL0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc170D3YXL0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc170D3YXL0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc170D3YXL0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc170D3YXL0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc170D3YXL0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc170D3YXL0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc170D3YXL0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc170D3YXL0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc170D3YXL0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc170D3YXL0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc170D3YXL0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc170D3YXL0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc170D3YXL0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc170D3YXL0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc170D3YXL0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc170D3YXL0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc170D3YXL0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc170D3YXL0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc170D3YXL0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc170D3YXL0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc170D3YXL0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc170D3YXL0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc170D3YXL0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc170D3YXL0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc170D3YXL0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc170D3YXL0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc170D3YXL0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc170D3YXL0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc170D3YXL0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc170D3YXL0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc170D3YXL0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc170D3YXL0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc170D3YXL0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc170D3YXL0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc170D3YXL0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc170D3YXL0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc170D3YXL0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc170D3YXL0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc170D3YXL0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc170D3YXL0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc170D3YXL0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc170D3YXL0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms