Protein–RNA interactions for Protein: D3YWB7

Gm4297, Predicted gene 4297, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4297D3YWB7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm4297D3YWB7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm4297D3YWB7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm4297D3YWB7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm4297D3YWB7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm4297D3YWB7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm4297D3YWB7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm4297D3YWB7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm4297D3YWB7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm4297D3YWB7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm4297D3YWB7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm4297D3YWB7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm4297D3YWB7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm4297D3YWB7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm4297D3YWB7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm4297D3YWB7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm4297D3YWB7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm4297D3YWB7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm4297D3YWB7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm4297D3YWB7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm4297D3YWB7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm4297D3YWB7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm4297D3YWB7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm4297D3YWB7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm4297D3YWB7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm4297D3YWB7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm4297D3YWB7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm4297D3YWB7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm4297D3YWB7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm4297D3YWB7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm4297D3YWB7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm4297D3YWB7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm4297D3YWB7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm4297D3YWB7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm4297D3YWB7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm4297D3YWB7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm4297D3YWB7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm4297D3YWB7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm4297D3YWB7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm4297D3YWB7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm4297D3YWB7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm4297D3YWB7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm4297D3YWB7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm4297D3YWB7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm4297D3YWB7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm4297D3YWB7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm4297D3YWB7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm4297D3YWB7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm4297D3YWB7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm4297D3YWB7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm4297D3YWB7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm4297D3YWB7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm4297D3YWB7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm4297D3YWB7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm4297D3YWB7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm4297D3YWB7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm4297D3YWB7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm4297D3YWB7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm4297D3YWB7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm4297D3YWB7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm4297D3YWB7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm4297D3YWB7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm4297D3YWB7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm4297D3YWB7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm4297D3YWB7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm4297D3YWB7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm4297D3YWB7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm4297D3YWB7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm4297D3YWB7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm4297D3YWB7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm4297D3YWB7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm4297D3YWB7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm4297D3YWB7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm4297D3YWB7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm4297D3YWB7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm4297D3YWB7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm4297D3YWB7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm4297D3YWB7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm4297D3YWB7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm4297D3YWB7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm4297D3YWB7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm4297D3YWB7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm4297D3YWB7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm4297D3YWB7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm4297D3YWB7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm4297D3YWB7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm4297D3YWB7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm4297D3YWB7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm4297D3YWB7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm4297D3YWB7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm4297D3YWB7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm4297D3YWB7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm4297D3YWB7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm4297D3YWB7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm4297D3YWB7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm4297D3YWB7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm4297D3YWB7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm4297D3YWB7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm4297D3YWB7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm4297D3YWB7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms