Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK0

Gm3259, Predicted gene 3259, mousemouse

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Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3259D3YUK0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3259D3YUK0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3259D3YUK0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3259D3YUK0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3259D3YUK0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3259D3YUK0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3259D3YUK0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3259D3YUK0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3259D3YUK0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3259D3YUK0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3259D3YUK0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3259D3YUK0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3259D3YUK0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3259D3YUK0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3259D3YUK0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3259D3YUK0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3259D3YUK0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3259D3YUK0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3259D3YUK0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
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Gm3259D3YUK0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3259D3YUK0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3259D3YUK0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Gm3259D3YUK0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3259D3YUK0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3259D3YUK0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3259D3YUK0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3259D3YUK0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3259D3YUK0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3259D3YUK0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3259D3YUK0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3259D3YUK0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3259D3YUK0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm3259D3YUK0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm3259D3YUK0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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Gm3259D3YUK0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm3259D3YUK0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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Gm3259D3YUK0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm3259D3YUK0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
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Gm3259D3YUK0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm3259D3YUK0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm3259D3YUK0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm3259D3YUK0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm3259D3YUK0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3259D3YUK0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3259D3YUK0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3259D3YUK0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3259D3YUK0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3259D3YUK0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm3259D3YUK0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm3259D3YUK0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm3259D3YUK0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm3259D3YUK0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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Gm3259D3YUK0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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Gm3259D3YUK0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm3259D3YUK0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm3259D3YUK0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm3259D3YUK0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm3259D3YUK0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm3259D3YUK0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm3259D3YUK0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm3259D3YUK0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm3259D3YUK0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm3259D3YUK0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Gm3259D3YUK0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gm3259D3YUK0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm3259D3YUK0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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Gm3259D3YUK0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm3259D3YUK0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm3259D3YUK0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm3259D3YUK0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm3259D3YUK0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm3259D3YUK0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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