Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Phf11cB4XVP9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Phf11cB4XVP9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Phf11cB4XVP9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Phf11cB4XVP9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Phf11cB4XVP9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Phf11cB4XVP9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Phf11cB4XVP9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Phf11cB4XVP9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Phf11cB4XVP9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Phf11cB4XVP9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Phf11cB4XVP9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Phf11cB4XVP9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Phf11cB4XVP9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Phf11cB4XVP9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Phf11cB4XVP9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Phf11cB4XVP9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Phf11cB4XVP9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Phf11cB4XVP9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Phf11cB4XVP9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Phf11cB4XVP9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Phf11cB4XVP9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Phf11cB4XVP9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Phf11cB4XVP9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Phf11cB4XVP9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Phf11cB4XVP9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Phf11cB4XVP9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Phf11cB4XVP9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Phf11cB4XVP9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Phf11cB4XVP9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Phf11cB4XVP9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Phf11cB4XVP9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Phf11cB4XVP9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Phf11cB4XVP9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Phf11cB4XVP9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Phf11cB4XVP9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Phf11cB4XVP9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Phf11cB4XVP9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Phf11cB4XVP9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Phf11cB4XVP9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Phf11cB4XVP9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Phf11cB4XVP9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Phf11cB4XVP9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Phf11cB4XVP9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Phf11cB4XVP9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Phf11cB4XVP9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Phf11cB4XVP9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Phf11cB4XVP9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Phf11cB4XVP9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Phf11cB4XVP9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Phf11cB4XVP9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Phf11cB4XVP9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Phf11cB4XVP9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Phf11cB4XVP9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Phf11cB4XVP9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Phf11cB4XVP9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Phf11cB4XVP9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Phf11cB4XVP9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Phf11cB4XVP9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Phf11cB4XVP9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Phf11cB4XVP9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Phf11cB4XVP9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Phf11cB4XVP9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Phf11cB4XVP9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Phf11cB4XVP9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Phf11cB4XVP9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Phf11cB4XVP9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Phf11cB4XVP9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Phf11cB4XVP9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Phf11cB4XVP9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Phf11cB4XVP9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Phf11cB4XVP9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Phf11cB4XVP9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Phf11cB4XVP9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Phf11cB4XVP9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Phf11cB4XVP9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Phf11cB4XVP9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Phf11cB4XVP9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Phf11cB4XVP9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Phf11cB4XVP9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Phf11cB4XVP9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Phf11cB4XVP9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Phf11cB4XVP9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Phf11cB4XVP9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Phf11cB4XVP9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Phf11cB4XVP9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Phf11cB4XVP9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Phf11cB4XVP9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Phf11cB4XVP9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Phf11cB4XVP9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Phf11cB4XVP9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Phf11cB4XVP9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Phf11cB4XVP9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Phf11cB4XVP9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Phf11cB4XVP9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Phf11cB4XVP9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Phf11cB4XVP9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Phf11cB4XVP9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Phf11cB4XVP9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Phf11cB4XVP9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms