Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cspp1B2RX88 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cspp1B2RX88 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cspp1B2RX88 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cspp1B2RX88 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cspp1B2RX88 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Cspp1B2RX88 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cspp1B2RX88 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cspp1B2RX88 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cspp1B2RX88 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cspp1B2RX88 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Cspp1B2RX88 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cspp1B2RX88 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cspp1B2RX88 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cspp1B2RX88 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cspp1B2RX88 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cspp1B2RX88 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cspp1B2RX88 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cspp1B2RX88 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cspp1B2RX88 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Cspp1B2RX88 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cspp1B2RX88 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cspp1B2RX88 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cspp1B2RX88 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cspp1B2RX88 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cspp1B2RX88 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cspp1B2RX88 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cspp1B2RX88 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cspp1B2RX88 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cspp1B2RX88 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cspp1B2RX88 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cspp1B2RX88 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cspp1B2RX88 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Cspp1B2RX88 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cspp1B2RX88 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cspp1B2RX88 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cspp1B2RX88 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cspp1B2RX88 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cspp1B2RX88 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cspp1B2RX88 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cspp1B2RX88 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cspp1B2RX88 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cspp1B2RX88 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cspp1B2RX88 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cspp1B2RX88 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cspp1B2RX88 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cspp1B2RX88 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cspp1B2RX88 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cspp1B2RX88 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cspp1B2RX88 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cspp1B2RX88 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cspp1B2RX88 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cspp1B2RX88 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Cspp1B2RX88 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cspp1B2RX88 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Cspp1B2RX88 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cspp1B2RX88 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cspp1B2RX88 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cspp1B2RX88 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cspp1B2RX88 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cspp1B2RX88 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cspp1B2RX88 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cspp1B2RX88 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cspp1B2RX88 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cspp1B2RX88 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cspp1B2RX88 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cspp1B2RX88 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cspp1B2RX88 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cspp1B2RX88 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cspp1B2RX88 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cspp1B2RX88 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cspp1B2RX88 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cspp1B2RX88 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cspp1B2RX88 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cspp1B2RX88 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cspp1B2RX88 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cspp1B2RX88 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cspp1B2RX88 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cspp1B2RX88 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cspp1B2RX88 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cspp1B2RX88 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cspp1B2RX88 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cspp1B2RX88 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cspp1B2RX88 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cspp1B2RX88 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cspp1B2RX88 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cspp1B2RX88 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cspp1B2RX88 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cspp1B2RX88 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cspp1B2RX88 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cspp1B2RX88 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cspp1B2RX88 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cspp1B2RX88 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cspp1B2RX88 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Cspp1B2RX88 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cspp1B2RX88 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cspp1B2RX88 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cspp1B2RX88 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cspp1B2RX88 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cspp1B2RX88 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms