Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prrt4B2RU40 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prrt4B2RU40 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prrt4B2RU40 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prrt4B2RU40 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prrt4B2RU40 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prrt4B2RU40 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prrt4B2RU40 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prrt4B2RU40 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prrt4B2RU40 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prrt4B2RU40 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prrt4B2RU40 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prrt4B2RU40 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prrt4B2RU40 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prrt4B2RU40 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prrt4B2RU40 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prrt4B2RU40 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prrt4B2RU40 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prrt4B2RU40 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Prrt4B2RU40 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prrt4B2RU40 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prrt4B2RU40 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prrt4B2RU40 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prrt4B2RU40 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prrt4B2RU40 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prrt4B2RU40 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prrt4B2RU40 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prrt4B2RU40 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prrt4B2RU40 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prrt4B2RU40 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Prrt4B2RU40 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prrt4B2RU40 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prrt4B2RU40 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prrt4B2RU40 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prrt4B2RU40 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prrt4B2RU40 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prrt4B2RU40 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prrt4B2RU40 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prrt4B2RU40 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prrt4B2RU40 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prrt4B2RU40 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prrt4B2RU40 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prrt4B2RU40 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prrt4B2RU40 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prrt4B2RU40 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prrt4B2RU40 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prrt4B2RU40 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prrt4B2RU40 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prrt4B2RU40 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prrt4B2RU40 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prrt4B2RU40 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prrt4B2RU40 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prrt4B2RU40 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prrt4B2RU40 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prrt4B2RU40 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prrt4B2RU40 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prrt4B2RU40 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Prrt4B2RU40 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prrt4B2RU40 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prrt4B2RU40 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prrt4B2RU40 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prrt4B2RU40 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prrt4B2RU40 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prrt4B2RU40 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prrt4B2RU40 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prrt4B2RU40 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prrt4B2RU40 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prrt4B2RU40 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prrt4B2RU40 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prrt4B2RU40 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prrt4B2RU40 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prrt4B2RU40 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prrt4B2RU40 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prrt4B2RU40 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prrt4B2RU40 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prrt4B2RU40 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prrt4B2RU40 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Prrt4B2RU40 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prrt4B2RU40 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prrt4B2RU40 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prrt4B2RU40 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prrt4B2RU40 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prrt4B2RU40 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prrt4B2RU40 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prrt4B2RU40 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prrt4B2RU40 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prrt4B2RU40 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prrt4B2RU40 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prrt4B2RU40 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prrt4B2RU40 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Prrt4B2RU40 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Prrt4B2RU40 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prrt4B2RU40 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prrt4B2RU40 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Prrt4B2RU40 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prrt4B2RU40 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prrt4B2RU40 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prrt4B2RU40 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prrt4B2RU40 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prrt4B2RU40 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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