Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apol7aB2RT54 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apol7aB2RT54 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apol7aB2RT54 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apol7aB2RT54 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Apol7aB2RT54 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Apol7aB2RT54 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Apol7aB2RT54 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Apol7aB2RT54 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Apol7aB2RT54 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Apol7aB2RT54 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Apol7aB2RT54 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Apol7aB2RT54 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Apol7aB2RT54 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Apol7aB2RT54 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Apol7aB2RT54 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Apol7aB2RT54 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Apol7aB2RT54 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Apol7aB2RT54 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Apol7aB2RT54 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Apol7aB2RT54 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Apol7aB2RT54 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Apol7aB2RT54 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Apol7aB2RT54 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Apol7aB2RT54 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Apol7aB2RT54 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Apol7aB2RT54 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Apol7aB2RT54 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Apol7aB2RT54 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Apol7aB2RT54 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Apol7aB2RT54 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apol7aB2RT54 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apol7aB2RT54 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apol7aB2RT54 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apol7aB2RT54 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Apol7aB2RT54 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Apol7aB2RT54 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Apol7aB2RT54 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Apol7aB2RT54 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Apol7aB2RT54 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Apol7aB2RT54 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Apol7aB2RT54 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Apol7aB2RT54 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Apol7aB2RT54 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Apol7aB2RT54 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Apol7aB2RT54 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Apol7aB2RT54 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Apol7aB2RT54 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Apol7aB2RT54 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Apol7aB2RT54 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Apol7aB2RT54 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Apol7aB2RT54 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Apol7aB2RT54 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Apol7aB2RT54 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Apol7aB2RT54 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Apol7aB2RT54 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apol7aB2RT54 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apol7aB2RT54 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Apol7aB2RT54 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apol7aB2RT54 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apol7aB2RT54 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apol7aB2RT54 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apol7aB2RT54 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apol7aB2RT54 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apol7aB2RT54 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apol7aB2RT54 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apol7aB2RT54 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apol7aB2RT54 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apol7aB2RT54 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apol7aB2RT54 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apol7aB2RT54 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apol7aB2RT54 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apol7aB2RT54 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apol7aB2RT54 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Apol7aB2RT54 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apol7aB2RT54 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apol7aB2RT54 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apol7aB2RT54 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Apol7aB2RT54 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Apol7aB2RT54 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apol7aB2RT54 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apol7aB2RT54 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apol7aB2RT54 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apol7aB2RT54 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apol7aB2RT54 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apol7aB2RT54 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apol7aB2RT54 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apol7aB2RT54 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apol7aB2RT54 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apol7aB2RT54 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apol7aB2RT54 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Apol7aB2RT54 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Apol7aB2RT54 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Apol7aB2RT54 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Apol7aB2RT54 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Apol7aB2RT54 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Apol7aB2RT54 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Apol7aB2RT54 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apol7aB2RT54 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Apol7aB2RT54 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms