Protein–RNA interactions for Protein: B1AVB3

Scml2, Scm polycomb group protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scml2B1AVB3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scml2B1AVB3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scml2B1AVB3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scml2B1AVB3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scml2B1AVB3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scml2B1AVB3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scml2B1AVB3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scml2B1AVB3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scml2B1AVB3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Scml2B1AVB3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scml2B1AVB3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scml2B1AVB3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scml2B1AVB3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scml2B1AVB3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scml2B1AVB3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scml2B1AVB3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scml2B1AVB3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scml2B1AVB3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scml2B1AVB3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scml2B1AVB3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scml2B1AVB3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scml2B1AVB3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scml2B1AVB3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scml2B1AVB3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scml2B1AVB3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scml2B1AVB3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scml2B1AVB3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scml2B1AVB3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scml2B1AVB3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scml2B1AVB3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scml2B1AVB3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scml2B1AVB3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scml2B1AVB3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scml2B1AVB3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scml2B1AVB3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scml2B1AVB3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scml2B1AVB3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scml2B1AVB3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scml2B1AVB3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scml2B1AVB3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scml2B1AVB3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scml2B1AVB3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scml2B1AVB3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scml2B1AVB3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scml2B1AVB3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scml2B1AVB3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Scml2B1AVB3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scml2B1AVB3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scml2B1AVB3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scml2B1AVB3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scml2B1AVB3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Scml2B1AVB3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Scml2B1AVB3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scml2B1AVB3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scml2B1AVB3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Scml2B1AVB3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scml2B1AVB3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scml2B1AVB3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scml2B1AVB3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scml2B1AVB3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scml2B1AVB3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scml2B1AVB3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scml2B1AVB3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scml2B1AVB3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Scml2B1AVB3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scml2B1AVB3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scml2B1AVB3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Scml2B1AVB3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scml2B1AVB3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Scml2B1AVB3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scml2B1AVB3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scml2B1AVB3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scml2B1AVB3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scml2B1AVB3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scml2B1AVB3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scml2B1AVB3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Scml2B1AVB3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scml2B1AVB3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scml2B1AVB3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scml2B1AVB3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scml2B1AVB3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scml2B1AVB3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scml2B1AVB3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scml2B1AVB3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scml2B1AVB3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Scml2B1AVB3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scml2B1AVB3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scml2B1AVB3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scml2B1AVB3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scml2B1AVB3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scml2B1AVB3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scml2B1AVB3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scml2B1AVB3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scml2B1AVB3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scml2B1AVB3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scml2B1AVB3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scml2B1AVB3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scml2B1AVB3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scml2B1AVB3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scml2B1AVB3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms