Protein–RNA interactions for Protein: A7UAK5

Pfkfb3, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2, 6-biphosphatase 3 splice variant 2, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfkfb3A7UAK5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pfkfb3A7UAK5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pfkfb3A7UAK5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pfkfb3A7UAK5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pfkfb3A7UAK5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pfkfb3A7UAK5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pfkfb3A7UAK5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pfkfb3A7UAK5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pfkfb3A7UAK5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pfkfb3A7UAK5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Pfkfb3A7UAK5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pfkfb3A7UAK5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pfkfb3A7UAK5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pfkfb3A7UAK5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pfkfb3A7UAK5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pfkfb3A7UAK5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pfkfb3A7UAK5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pfkfb3A7UAK5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pfkfb3A7UAK5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Pfkfb3A7UAK5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pfkfb3A7UAK5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pfkfb3A7UAK5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pfkfb3A7UAK5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pfkfb3A7UAK5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pfkfb3A7UAK5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pfkfb3A7UAK5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pfkfb3A7UAK5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pfkfb3A7UAK5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pfkfb3A7UAK5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pfkfb3A7UAK5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pfkfb3A7UAK5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Pfkfb3A7UAK5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pfkfb3A7UAK5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pfkfb3A7UAK5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Pfkfb3A7UAK5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pfkfb3A7UAK5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pfkfb3A7UAK5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pfkfb3A7UAK5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pfkfb3A7UAK5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Pfkfb3A7UAK5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pfkfb3A7UAK5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pfkfb3A7UAK5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pfkfb3A7UAK5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pfkfb3A7UAK5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pfkfb3A7UAK5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pfkfb3A7UAK5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pfkfb3A7UAK5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Pfkfb3A7UAK5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pfkfb3A7UAK5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pfkfb3A7UAK5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pfkfb3A7UAK5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pfkfb3A7UAK5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pfkfb3A7UAK5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pfkfb3A7UAK5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pfkfb3A7UAK5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pfkfb3A7UAK5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pfkfb3A7UAK5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pfkfb3A7UAK5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pfkfb3A7UAK5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pfkfb3A7UAK5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Pfkfb3A7UAK5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pfkfb3A7UAK5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pfkfb3A7UAK5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pfkfb3A7UAK5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pfkfb3A7UAK5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pfkfb3A7UAK5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Pfkfb3A7UAK5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pfkfb3A7UAK5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pfkfb3A7UAK5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pfkfb3A7UAK5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pfkfb3A7UAK5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pfkfb3A7UAK5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pfkfb3A7UAK5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Pfkfb3A7UAK5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pfkfb3A7UAK5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pfkfb3A7UAK5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pfkfb3A7UAK5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pfkfb3A7UAK5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pfkfb3A7UAK5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pfkfb3A7UAK5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pfkfb3A7UAK5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pfkfb3A7UAK5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Pfkfb3A7UAK5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pfkfb3A7UAK5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pfkfb3A7UAK5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pfkfb3A7UAK5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pfkfb3A7UAK5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pfkfb3A7UAK5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pfkfb3A7UAK5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pfkfb3A7UAK5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pfkfb3A7UAK5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pfkfb3A7UAK5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pfkfb3A7UAK5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pfkfb3A7UAK5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pfkfb3A7UAK5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pfkfb3A7UAK5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pfkfb3A7UAK5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pfkfb3A7UAK5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pfkfb3A7UAK5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pfkfb3A7UAK5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms