Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3173A6NAS3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3173A6NAS3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3173A6NAS3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3173A6NAS3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3173A6NAS3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3173A6NAS3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3173A6NAS3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3173A6NAS3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3173A6NAS3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3173A6NAS3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3173A6NAS3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3173A6NAS3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3173A6NAS3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3173A6NAS3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3173A6NAS3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3173A6NAS3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3173A6NAS3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3173A6NAS3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3173A6NAS3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3173A6NAS3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3173A6NAS3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3173A6NAS3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3173A6NAS3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3173A6NAS3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3173A6NAS3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3173A6NAS3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3173A6NAS3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3173A6NAS3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3173A6NAS3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm3173A6NAS3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm3173A6NAS3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm3173A6NAS3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm3173A6NAS3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm3173A6NAS3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm3173A6NAS3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gm3173A6NAS3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm3173A6NAS3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm3173A6NAS3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3173A6NAS3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3173A6NAS3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3173A6NAS3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3173A6NAS3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3173A6NAS3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3173A6NAS3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3173A6NAS3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3173A6NAS3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3173A6NAS3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3173A6NAS3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3173A6NAS3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3173A6NAS3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3173A6NAS3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3173A6NAS3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3173A6NAS3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3173A6NAS3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3173A6NAS3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3173A6NAS3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3173A6NAS3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3173A6NAS3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3173A6NAS3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3173A6NAS3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3173A6NAS3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3173A6NAS3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3173A6NAS3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3173A6NAS3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3173A6NAS3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3173A6NAS3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3173A6NAS3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3173A6NAS3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3173A6NAS3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3173A6NAS3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3173A6NAS3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3173A6NAS3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3173A6NAS3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3173A6NAS3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3173A6NAS3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3173A6NAS3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm3173A6NAS3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm3173A6NAS3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3173A6NAS3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3173A6NAS3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3173A6NAS3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3173A6NAS3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3173A6NAS3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3173A6NAS3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3173A6NAS3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3173A6NAS3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3173A6NAS3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3173A6NAS3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3173A6NAS3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3173A6NAS3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3173A6NAS3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3173A6NAS3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3173A6NAS3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3173A6NAS3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3173A6NAS3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3173A6NAS3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3173A6NAS3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3173A6NAS3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3173A6NAS3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms