Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ttll11A4Q9F4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ttll11A4Q9F4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ttll11A4Q9F4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ttll11A4Q9F4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ttll11A4Q9F4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ttll11A4Q9F4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ttll11A4Q9F4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ttll11A4Q9F4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ttll11A4Q9F4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ttll11A4Q9F4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ttll11A4Q9F4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ttll11A4Q9F4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ttll11A4Q9F4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ttll11A4Q9F4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ttll11A4Q9F4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ttll11A4Q9F4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ttll11A4Q9F4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ttll11A4Q9F4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ttll11A4Q9F4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ttll11A4Q9F4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttll11A4Q9F4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttll11A4Q9F4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttll11A4Q9F4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttll11A4Q9F4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttll11A4Q9F4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttll11A4Q9F4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttll11A4Q9F4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttll11A4Q9F4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttll11A4Q9F4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttll11A4Q9F4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttll11A4Q9F4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttll11A4Q9F4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttll11A4Q9F4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttll11A4Q9F4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttll11A4Q9F4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttll11A4Q9F4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttll11A4Q9F4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttll11A4Q9F4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttll11A4Q9F4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttll11A4Q9F4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttll11A4Q9F4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttll11A4Q9F4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttll11A4Q9F4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttll11A4Q9F4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttll11A4Q9F4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttll11A4Q9F4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttll11A4Q9F4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttll11A4Q9F4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttll11A4Q9F4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttll11A4Q9F4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttll11A4Q9F4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttll11A4Q9F4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttll11A4Q9F4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttll11A4Q9F4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttll11A4Q9F4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttll11A4Q9F4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttll11A4Q9F4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttll11A4Q9F4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttll11A4Q9F4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttll11A4Q9F4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttll11A4Q9F4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttll11A4Q9F4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttll11A4Q9F4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttll11A4Q9F4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ttll11A4Q9F4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ttll11A4Q9F4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ttll11A4Q9F4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ttll11A4Q9F4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ttll11A4Q9F4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ttll11A4Q9F4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ttll11A4Q9F4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ttll11A4Q9F4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ttll11A4Q9F4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ttll11A4Q9F4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ttll11A4Q9F4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ttll11A4Q9F4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ttll11A4Q9F4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ttll11A4Q9F4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttll11A4Q9F4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttll11A4Q9F4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttll11A4Q9F4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttll11A4Q9F4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttll11A4Q9F4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttll11A4Q9F4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttll11A4Q9F4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttll11A4Q9F4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttll11A4Q9F4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttll11A4Q9F4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttll11A4Q9F4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttll11A4Q9F4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttll11A4Q9F4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttll11A4Q9F4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttll11A4Q9F4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttll11A4Q9F4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttll11A4Q9F4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttll11A4Q9F4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttll11A4Q9F4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttll11A4Q9F4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttll11A4Q9F4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms