Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prr16A3KMN5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prr16A3KMN5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Prr16A3KMN5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prr16A3KMN5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prr16A3KMN5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prr16A3KMN5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prr16A3KMN5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Prr16A3KMN5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prr16A3KMN5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prr16A3KMN5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prr16A3KMN5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prr16A3KMN5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prr16A3KMN5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prr16A3KMN5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prr16A3KMN5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prr16A3KMN5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prr16A3KMN5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prr16A3KMN5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prr16A3KMN5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prr16A3KMN5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prr16A3KMN5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prr16A3KMN5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prr16A3KMN5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Prr16A3KMN5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prr16A3KMN5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prr16A3KMN5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prr16A3KMN5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prr16A3KMN5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Prr16A3KMN5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prr16A3KMN5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prr16A3KMN5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prr16A3KMN5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prr16A3KMN5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prr16A3KMN5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prr16A3KMN5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prr16A3KMN5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Prr16A3KMN5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prr16A3KMN5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prr16A3KMN5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prr16A3KMN5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prr16A3KMN5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prr16A3KMN5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prr16A3KMN5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prr16A3KMN5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prr16A3KMN5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prr16A3KMN5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prr16A3KMN5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prr16A3KMN5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prr16A3KMN5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prr16A3KMN5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prr16A3KMN5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prr16A3KMN5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prr16A3KMN5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prr16A3KMN5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prr16A3KMN5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prr16A3KMN5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Prr16A3KMN5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prr16A3KMN5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prr16A3KMN5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prr16A3KMN5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prr16A3KMN5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prr16A3KMN5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Prr16A3KMN5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Prr16A3KMN5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prr16A3KMN5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prr16A3KMN5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prr16A3KMN5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prr16A3KMN5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prr16A3KMN5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prr16A3KMN5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prr16A3KMN5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prr16A3KMN5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prr16A3KMN5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Prr16A3KMN5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prr16A3KMN5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prr16A3KMN5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prr16A3KMN5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prr16A3KMN5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prr16A3KMN5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prr16A3KMN5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prr16A3KMN5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prr16A3KMN5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prr16A3KMN5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prr16A3KMN5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prr16A3KMN5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prr16A3KMN5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prr16A3KMN5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prr16A3KMN5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prr16A3KMN5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prr16A3KMN5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prr16A3KMN5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prr16A3KMN5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prr16A3KMN5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prr16A3KMN5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prr16A3KMN5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prr16A3KMN5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prr16A3KMN5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prr16A3KMN5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prr16A3KMN5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms