Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf39A2RT81 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf39A2RT81 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf39A2RT81 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf39A2RT81 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf39A2RT81 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf39A2RT81 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf39A2RT81 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf39A2RT81 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf39A2RT81 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf39A2RT81 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf39A2RT81 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf39A2RT81 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf39A2RT81 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf39A2RT81 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf39A2RT81 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf39A2RT81 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf39A2RT81 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf39A2RT81 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf39A2RT81 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf39A2RT81 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf39A2RT81 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf39A2RT81 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf39A2RT81 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf39A2RT81 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf39A2RT81 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf39A2RT81 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf39A2RT81 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf39A2RT81 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf39A2RT81 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf39A2RT81 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf39A2RT81 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf39A2RT81 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf39A2RT81 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf39A2RT81 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf39A2RT81 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf39A2RT81 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf39A2RT81 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf39A2RT81 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf39A2RT81 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf39A2RT81 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf39A2RT81 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf39A2RT81 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf39A2RT81 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf39A2RT81 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf39A2RT81 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf39A2RT81 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf39A2RT81 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf39A2RT81 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf39A2RT81 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf39A2RT81 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf39A2RT81 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf39A2RT81 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf39A2RT81 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf39A2RT81 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf39A2RT81 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf39A2RT81 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf39A2RT81 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf39A2RT81 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf39A2RT81 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf39A2RT81 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf39A2RT81 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf39A2RT81 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rnf39A2RT81 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rnf39A2RT81 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rnf39A2RT81 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf39A2RT81 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf39A2RT81 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf39A2RT81 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf39A2RT81 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf39A2RT81 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf39A2RT81 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf39A2RT81 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf39A2RT81 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf39A2RT81 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf39A2RT81 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf39A2RT81 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf39A2RT81 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf39A2RT81 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf39A2RT81 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf39A2RT81 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf39A2RT81 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf39A2RT81 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf39A2RT81 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf39A2RT81 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf39A2RT81 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf39A2RT81 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf39A2RT81 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf39A2RT81 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf39A2RT81 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf39A2RT81 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf39A2RT81 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf39A2RT81 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf39A2RT81 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf39A2RT81 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf39A2RT81 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf39A2RT81 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf39A2RT81 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf39A2RT81 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf39A2RT81 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 208 ms