Protein–RNA interactions for Protein: A2RT62

Fbxl16, F-box/LRR-repeat protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxl16A2RT62 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fbxl16A2RT62 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fbxl16A2RT62 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fbxl16A2RT62 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fbxl16A2RT62 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fbxl16A2RT62 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fbxl16A2RT62 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fbxl16A2RT62 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fbxl16A2RT62 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fbxl16A2RT62 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fbxl16A2RT62 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fbxl16A2RT62 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fbxl16A2RT62 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fbxl16A2RT62 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fbxl16A2RT62 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Fbxl16A2RT62 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fbxl16A2RT62 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fbxl16A2RT62 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fbxl16A2RT62 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fbxl16A2RT62 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fbxl16A2RT62 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fbxl16A2RT62 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fbxl16A2RT62 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fbxl16A2RT62 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fbxl16A2RT62 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fbxl16A2RT62 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Fbxl16A2RT62 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fbxl16A2RT62 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fbxl16A2RT62 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fbxl16A2RT62 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fbxl16A2RT62 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fbxl16A2RT62 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fbxl16A2RT62 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fbxl16A2RT62 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fbxl16A2RT62 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fbxl16A2RT62 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fbxl16A2RT62 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fbxl16A2RT62 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fbxl16A2RT62 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fbxl16A2RT62 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fbxl16A2RT62 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fbxl16A2RT62 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fbxl16A2RT62 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fbxl16A2RT62 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fbxl16A2RT62 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fbxl16A2RT62 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fbxl16A2RT62 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fbxl16A2RT62 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fbxl16A2RT62 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fbxl16A2RT62 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Fbxl16A2RT62 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Fbxl16A2RT62 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fbxl16A2RT62 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fbxl16A2RT62 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Fbxl16A2RT62 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fbxl16A2RT62 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fbxl16A2RT62 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fbxl16A2RT62 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Fbxl16A2RT62 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fbxl16A2RT62 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fbxl16A2RT62 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Fbxl16A2RT62 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fbxl16A2RT62 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fbxl16A2RT62 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fbxl16A2RT62 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fbxl16A2RT62 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fbxl16A2RT62 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fbxl16A2RT62 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fbxl16A2RT62 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fbxl16A2RT62 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fbxl16A2RT62 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Fbxl16A2RT62 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fbxl16A2RT62 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Fbxl16A2RT62 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fbxl16A2RT62 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fbxl16A2RT62 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fbxl16A2RT62 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Fbxl16A2RT62 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Fbxl16A2RT62 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fbxl16A2RT62 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Fbxl16A2RT62 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fbxl16A2RT62 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fbxl16A2RT62 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fbxl16A2RT62 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fbxl16A2RT62 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fbxl16A2RT62 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fbxl16A2RT62 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fbxl16A2RT62 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Fbxl16A2RT62 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fbxl16A2RT62 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fbxl16A2RT62 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fbxl16A2RT62 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fbxl16A2RT62 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fbxl16A2RT62 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fbxl16A2RT62 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fbxl16A2RT62 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fbxl16A2RT62 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fbxl16A2RT62 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fbxl16A2RT62 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fbxl16A2RT62 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms