Protein–RNA interactions for Protein: A2ASJ1

Pramef17, PRAME family member 17, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef17A2ASJ1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pramef17A2ASJ1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pramef17A2ASJ1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pramef17A2ASJ1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pramef17A2ASJ1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pramef17A2ASJ1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pramef17A2ASJ1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pramef17A2ASJ1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pramef17A2ASJ1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pramef17A2ASJ1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pramef17A2ASJ1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pramef17A2ASJ1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pramef17A2ASJ1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pramef17A2ASJ1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pramef17A2ASJ1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pramef17A2ASJ1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Pramef17A2ASJ1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pramef17A2ASJ1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pramef17A2ASJ1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pramef17A2ASJ1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pramef17A2ASJ1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Pramef17A2ASJ1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pramef17A2ASJ1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pramef17A2ASJ1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pramef17A2ASJ1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Pramef17A2ASJ1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pramef17A2ASJ1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pramef17A2ASJ1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pramef17A2ASJ1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Pramef17A2ASJ1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pramef17A2ASJ1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pramef17A2ASJ1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pramef17A2ASJ1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pramef17A2ASJ1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pramef17A2ASJ1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pramef17A2ASJ1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pramef17A2ASJ1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pramef17A2ASJ1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pramef17A2ASJ1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pramef17A2ASJ1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pramef17A2ASJ1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pramef17A2ASJ1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pramef17A2ASJ1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pramef17A2ASJ1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pramef17A2ASJ1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pramef17A2ASJ1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pramef17A2ASJ1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pramef17A2ASJ1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pramef17A2ASJ1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pramef17A2ASJ1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pramef17A2ASJ1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Pramef17A2ASJ1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pramef17A2ASJ1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pramef17A2ASJ1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pramef17A2ASJ1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pramef17A2ASJ1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pramef17A2ASJ1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pramef17A2ASJ1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Pramef17A2ASJ1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pramef17A2ASJ1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pramef17A2ASJ1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pramef17A2ASJ1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pramef17A2ASJ1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pramef17A2ASJ1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pramef17A2ASJ1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pramef17A2ASJ1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pramef17A2ASJ1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pramef17A2ASJ1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pramef17A2ASJ1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pramef17A2ASJ1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pramef17A2ASJ1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pramef17A2ASJ1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pramef17A2ASJ1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pramef17A2ASJ1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pramef17A2ASJ1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pramef17A2ASJ1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pramef17A2ASJ1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Pramef17A2ASJ1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Pramef17A2ASJ1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pramef17A2ASJ1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pramef17A2ASJ1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pramef17A2ASJ1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pramef17A2ASJ1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pramef17A2ASJ1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pramef17A2ASJ1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pramef17A2ASJ1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pramef17A2ASJ1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pramef17A2ASJ1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pramef17A2ASJ1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pramef17A2ASJ1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pramef17A2ASJ1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pramef17A2ASJ1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pramef17A2ASJ1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Pramef17A2ASJ1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pramef17A2ASJ1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pramef17A2ASJ1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pramef17A2ASJ1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pramef17A2ASJ1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pramef17A2ASJ1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Pramef17A2ASJ1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms