Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtcflA2APF3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtcflA2APF3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtcflA2APF3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtcflA2APF3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtcflA2APF3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtcflA2APF3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtcflA2APF3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtcflA2APF3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtcflA2APF3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtcflA2APF3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtcflA2APF3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtcflA2APF3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtcflA2APF3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtcflA2APF3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtcflA2APF3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtcflA2APF3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtcflA2APF3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CtcflA2APF3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtcflA2APF3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtcflA2APF3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtcflA2APF3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtcflA2APF3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtcflA2APF3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtcflA2APF3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtcflA2APF3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtcflA2APF3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtcflA2APF3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtcflA2APF3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtcflA2APF3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtcflA2APF3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtcflA2APF3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtcflA2APF3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CtcflA2APF3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CtcflA2APF3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CtcflA2APF3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CtcflA2APF3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CtcflA2APF3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CtcflA2APF3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CtcflA2APF3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CtcflA2APF3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CtcflA2APF3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CtcflA2APF3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CtcflA2APF3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CtcflA2APF3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CtcflA2APF3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CtcflA2APF3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CtcflA2APF3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CtcflA2APF3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CtcflA2APF3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CtcflA2APF3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CtcflA2APF3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CtcflA2APF3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CtcflA2APF3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CtcflA2APF3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CtcflA2APF3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CtcflA2APF3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CtcflA2APF3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CtcflA2APF3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CtcflA2APF3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CtcflA2APF3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CtcflA2APF3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CtcflA2APF3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CtcflA2APF3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CtcflA2APF3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CtcflA2APF3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CtcflA2APF3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CtcflA2APF3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CtcflA2APF3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CtcflA2APF3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CtcflA2APF3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CtcflA2APF3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CtcflA2APF3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CtcflA2APF3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CtcflA2APF3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CtcflA2APF3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CtcflA2APF3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CtcflA2APF3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CtcflA2APF3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CtcflA2APF3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CtcflA2APF3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CtcflA2APF3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CtcflA2APF3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CtcflA2APF3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CtcflA2APF3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CtcflA2APF3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CtcflA2APF3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CtcflA2APF3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CtcflA2APF3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CtcflA2APF3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CtcflA2APF3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CtcflA2APF3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CtcflA2APF3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CtcflA2APF3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CtcflA2APF3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CtcflA2APF3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CtcflA2APF3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CtcflA2APF3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CtcflA2APF3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CtcflA2APF3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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