Protein–RNA interactions for Protein: A2AJN7

Slc4a11, Sodium bicarbonate transporter-like protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a11A2AJN7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc4a11A2AJN7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc4a11A2AJN7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc4a11A2AJN7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc4a11A2AJN7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc4a11A2AJN7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc4a11A2AJN7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc4a11A2AJN7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc4a11A2AJN7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc4a11A2AJN7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc4a11A2AJN7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc4a11A2AJN7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc4a11A2AJN7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc4a11A2AJN7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc4a11A2AJN7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc4a11A2AJN7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc4a11A2AJN7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc4a11A2AJN7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc4a11A2AJN7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc4a11A2AJN7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc4a11A2AJN7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc4a11A2AJN7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc4a11A2AJN7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc4a11A2AJN7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc4a11A2AJN7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc4a11A2AJN7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc4a11A2AJN7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc4a11A2AJN7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc4a11A2AJN7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc4a11A2AJN7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc4a11A2AJN7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc4a11A2AJN7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc4a11A2AJN7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc4a11A2AJN7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc4a11A2AJN7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc4a11A2AJN7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc4a11A2AJN7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc4a11A2AJN7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc4a11A2AJN7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc4a11A2AJN7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc4a11A2AJN7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc4a11A2AJN7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc4a11A2AJN7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc4a11A2AJN7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc4a11A2AJN7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc4a11A2AJN7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc4a11A2AJN7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc4a11A2AJN7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc4a11A2AJN7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc4a11A2AJN7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc4a11A2AJN7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc4a11A2AJN7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc4a11A2AJN7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc4a11A2AJN7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc4a11A2AJN7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc4a11A2AJN7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc4a11A2AJN7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc4a11A2AJN7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc4a11A2AJN7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc4a11A2AJN7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc4a11A2AJN7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc4a11A2AJN7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc4a11A2AJN7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc4a11A2AJN7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc4a11A2AJN7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc4a11A2AJN7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc4a11A2AJN7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc4a11A2AJN7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc4a11A2AJN7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc4a11A2AJN7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc4a11A2AJN7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc4a11A2AJN7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc4a11A2AJN7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc4a11A2AJN7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc4a11A2AJN7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc4a11A2AJN7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc4a11A2AJN7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc4a11A2AJN7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc4a11A2AJN7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc4a11A2AJN7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Slc4a11A2AJN7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc4a11A2AJN7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc4a11A2AJN7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc4a11A2AJN7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc4a11A2AJN7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc4a11A2AJN7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc4a11A2AJN7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc4a11A2AJN7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc4a11A2AJN7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc4a11A2AJN7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc4a11A2AJN7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc4a11A2AJN7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc4a11A2AJN7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc4a11A2AJN7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc4a11A2AJN7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc4a11A2AJN7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc4a11A2AJN7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc4a11A2AJN7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc4a11A2AJN7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc4a11A2AJN7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms