Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lcn6A2AJB9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lcn6A2AJB9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Lcn6A2AJB9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lcn6A2AJB9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lcn6A2AJB9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lcn6A2AJB9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lcn6A2AJB9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Lcn6A2AJB9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lcn6A2AJB9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lcn6A2AJB9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lcn6A2AJB9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lcn6A2AJB9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lcn6A2AJB9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lcn6A2AJB9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lcn6A2AJB9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lcn6A2AJB9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lcn6A2AJB9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lcn6A2AJB9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lcn6A2AJB9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lcn6A2AJB9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lcn6A2AJB9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lcn6A2AJB9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lcn6A2AJB9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lcn6A2AJB9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lcn6A2AJB9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lcn6A2AJB9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lcn6A2AJB9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lcn6A2AJB9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lcn6A2AJB9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lcn6A2AJB9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lcn6A2AJB9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lcn6A2AJB9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Lcn6A2AJB9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lcn6A2AJB9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lcn6A2AJB9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lcn6A2AJB9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lcn6A2AJB9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lcn6A2AJB9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lcn6A2AJB9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lcn6A2AJB9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lcn6A2AJB9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lcn6A2AJB9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lcn6A2AJB9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lcn6A2AJB9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lcn6A2AJB9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lcn6A2AJB9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lcn6A2AJB9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lcn6A2AJB9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lcn6A2AJB9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lcn6A2AJB9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Lcn6A2AJB9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lcn6A2AJB9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lcn6A2AJB9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lcn6A2AJB9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lcn6A2AJB9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lcn6A2AJB9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lcn6A2AJB9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lcn6A2AJB9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lcn6A2AJB9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lcn6A2AJB9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lcn6A2AJB9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lcn6A2AJB9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lcn6A2AJB9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lcn6A2AJB9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Lcn6A2AJB9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lcn6A2AJB9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lcn6A2AJB9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lcn6A2AJB9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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Lcn6A2AJB9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lcn6A2AJB9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lcn6A2AJB9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lcn6A2AJB9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Lcn6A2AJB9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lcn6A2AJB9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lcn6A2AJB9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lcn6A2AJB9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lcn6A2AJB9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lcn6A2AJB9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lcn6A2AJB9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lcn6A2AJB9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lcn6A2AJB9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lcn6A2AJB9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lcn6A2AJB9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lcn6A2AJB9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lcn6A2AJB9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lcn6A2AJB9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lcn6A2AJB9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lcn6A2AJB9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lcn6A2AJB9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lcn6A2AJB9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lcn6A2AJB9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lcn6A2AJB9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lcn6A2AJB9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lcn6A2AJB9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Lcn6A2AJB9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Lcn6A2AJB9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lcn6A2AJB9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lcn6A2AJB9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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