Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Rbbp8nlA2ABX0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rbbp8nlA2ABX0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rbbp8nlA2ABX0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rbbp8nlA2ABX0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rbbp8nlA2ABX0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rbbp8nlA2ABX0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Rbbp8nlA2ABX0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rbbp8nlA2ABX0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rbbp8nlA2ABX0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Rbbp8nlA2ABX0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rbbp8nlA2ABX0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rbbp8nlA2ABX0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rbbp8nlA2ABX0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rbbp8nlA2ABX0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rbbp8nlA2ABX0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rbbp8nlA2ABX0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rbbp8nlA2ABX0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rbbp8nlA2ABX0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rbbp8nlA2ABX0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rbbp8nlA2ABX0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rbbp8nlA2ABX0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rbbp8nlA2ABX0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rbbp8nlA2ABX0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rbbp8nlA2ABX0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rbbp8nlA2ABX0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rbbp8nlA2ABX0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rbbp8nlA2ABX0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rbbp8nlA2ABX0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rbbp8nlA2ABX0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rbbp8nlA2ABX0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rbbp8nlA2ABX0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rbbp8nlA2ABX0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rbbp8nlA2ABX0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rbbp8nlA2ABX0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rbbp8nlA2ABX0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rbbp8nlA2ABX0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rbbp8nlA2ABX0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rbbp8nlA2ABX0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rbbp8nlA2ABX0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rbbp8nlA2ABX0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rbbp8nlA2ABX0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Rbbp8nlA2ABX0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Rbbp8nlA2ABX0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rbbp8nlA2ABX0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rbbp8nlA2ABX0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rbbp8nlA2ABX0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rbbp8nlA2ABX0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rbbp8nlA2ABX0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rbbp8nlA2ABX0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rbbp8nlA2ABX0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rbbp8nlA2ABX0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rbbp8nlA2ABX0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Rbbp8nlA2ABX0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rbbp8nlA2ABX0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Rbbp8nlA2ABX0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rbbp8nlA2ABX0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rbbp8nlA2ABX0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rbbp8nlA2ABX0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Rbbp8nlA2ABX0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rbbp8nlA2ABX0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rbbp8nlA2ABX0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rbbp8nlA2ABX0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rbbp8nlA2ABX0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rbbp8nlA2ABX0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Rbbp8nlA2ABX0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Rbbp8nlA2ABX0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rbbp8nlA2ABX0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rbbp8nlA2ABX0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rbbp8nlA2ABX0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rbbp8nlA2ABX0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rbbp8nlA2ABX0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rbbp8nlA2ABX0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rbbp8nlA2ABX0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rbbp8nlA2ABX0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rbbp8nlA2ABX0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rbbp8nlA2ABX0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rbbp8nlA2ABX0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rbbp8nlA2ABX0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rbbp8nlA2ABX0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rbbp8nlA2ABX0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rbbp8nlA2ABX0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rbbp8nlA2ABX0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rbbp8nlA2ABX0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rbbp8nlA2ABX0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rbbp8nlA2ABX0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rbbp8nlA2ABX0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Rbbp8nlA2ABX0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rbbp8nlA2ABX0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rbbp8nlA2ABX0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms