Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprfA2A8L5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprfA2A8L5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprfA2A8L5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprfA2A8L5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprfA2A8L5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprfA2A8L5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprfA2A8L5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprfA2A8L5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprfA2A8L5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprfA2A8L5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprfA2A8L5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprfA2A8L5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprfA2A8L5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprfA2A8L5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprfA2A8L5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprfA2A8L5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprfA2A8L5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprfA2A8L5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprfA2A8L5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprfA2A8L5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprfA2A8L5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprfA2A8L5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtprfA2A8L5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtprfA2A8L5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtprfA2A8L5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtprfA2A8L5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PtprfA2A8L5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PtprfA2A8L5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PtprfA2A8L5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PtprfA2A8L5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PtprfA2A8L5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprfA2A8L5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprfA2A8L5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprfA2A8L5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprfA2A8L5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprfA2A8L5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprfA2A8L5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprfA2A8L5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprfA2A8L5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprfA2A8L5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprfA2A8L5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprfA2A8L5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprfA2A8L5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprfA2A8L5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprfA2A8L5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprfA2A8L5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprfA2A8L5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprfA2A8L5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprfA2A8L5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprfA2A8L5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprfA2A8L5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprfA2A8L5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprfA2A8L5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprfA2A8L5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprfA2A8L5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprfA2A8L5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprfA2A8L5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprfA2A8L5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprfA2A8L5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprfA2A8L5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprfA2A8L5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprfA2A8L5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprfA2A8L5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprfA2A8L5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprfA2A8L5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprfA2A8L5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprfA2A8L5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprfA2A8L5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprfA2A8L5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprfA2A8L5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprfA2A8L5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprfA2A8L5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprfA2A8L5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprfA2A8L5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprfA2A8L5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprfA2A8L5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PtprfA2A8L5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
PtprfA2A8L5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PtprfA2A8L5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
PtprfA2A8L5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprfA2A8L5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprfA2A8L5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprfA2A8L5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprfA2A8L5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprfA2A8L5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprfA2A8L5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprfA2A8L5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprfA2A8L5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprfA2A8L5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprfA2A8L5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprfA2A8L5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprfA2A8L5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprfA2A8L5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprfA2A8L5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprfA2A8L5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprfA2A8L5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprfA2A8L5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprfA2A8L5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprfA2A8L5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
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