Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trav12-2A0N8N6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trav12-2A0N8N6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Trav12-2A0N8N6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trav12-2A0N8N6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trav12-2A0N8N6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trav12-2A0N8N6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trav12-2A0N8N6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trav12-2A0N8N6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trav12-2A0N8N6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trav12-2A0N8N6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trav12-2A0N8N6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trav12-2A0N8N6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trav12-2A0N8N6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trav12-2A0N8N6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trav12-2A0N8N6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trav12-2A0N8N6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trav12-2A0N8N6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trav12-2A0N8N6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trav12-2A0N8N6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trav12-2A0N8N6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trav12-2A0N8N6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trav12-2A0N8N6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trav12-2A0N8N6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Trav12-2A0N8N6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trav12-2A0N8N6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trav12-2A0N8N6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trav12-2A0N8N6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trav12-2A0N8N6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trav12-2A0N8N6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trav12-2A0N8N6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trav12-2A0N8N6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trav12-2A0N8N6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trav12-2A0N8N6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trav12-2A0N8N6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trav12-2A0N8N6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trav12-2A0N8N6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trav12-2A0N8N6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trav12-2A0N8N6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trav12-2A0N8N6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trav12-2A0N8N6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trav12-2A0N8N6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trav12-2A0N8N6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trav12-2A0N8N6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trav12-2A0N8N6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trav12-2A0N8N6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Trav12-2A0N8N6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trav12-2A0N8N6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trav12-2A0N8N6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Trav12-2A0N8N6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trav12-2A0N8N6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trav12-2A0N8N6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trav12-2A0N8N6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trav12-2A0N8N6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trav12-2A0N8N6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trav12-2A0N8N6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trav12-2A0N8N6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trav12-2A0N8N6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trav12-2A0N8N6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trav12-2A0N8N6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trav12-2A0N8N6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trav12-2A0N8N6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trav12-2A0N8N6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trav12-2A0N8N6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trav12-2A0N8N6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trav12-2A0N8N6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trav12-2A0N8N6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trav12-2A0N8N6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Trav12-2A0N8N6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trav12-2A0N8N6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trav12-2A0N8N6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trav12-2A0N8N6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trav12-2A0N8N6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trav12-2A0N8N6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trav12-2A0N8N6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trav12-2A0N8N6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trav12-2A0N8N6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trav12-2A0N8N6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trav12-2A0N8N6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trav12-2A0N8N6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trav12-2A0N8N6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trav12-2A0N8N6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trav12-2A0N8N6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trav12-2A0N8N6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trav12-2A0N8N6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trav12-2A0N8N6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trav12-2A0N8N6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trav12-2A0N8N6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trav12-2A0N8N6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trav12-2A0N8N6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trav12-2A0N8N6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trav12-2A0N8N6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trav12-2A0N8N6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trav12-2A0N8N6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trav12-2A0N8N6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trav12-2A0N8N6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trav12-2A0N8N6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trav12-2A0N8N6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trav12-2A0N8N6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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