Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GRH6

Zscan4-ps3, Zinc finger and SCAN domain containing 4, pseudogene 3, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
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