Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIX9

Cfap99, Cilia and flagella-associated protein 99, mousemouse

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Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap99A0A140LIX9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cfap99A0A140LIX9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cfap99A0A140LIX9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cfap99A0A140LIX9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cfap99A0A140LIX9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cfap99A0A140LIX9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cfap99A0A140LIX9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cfap99A0A140LIX9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cfap99A0A140LIX9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cfap99A0A140LIX9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cfap99A0A140LIX9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cfap99A0A140LIX9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Cfap99A0A140LIX9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cfap99A0A140LIX9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cfap99A0A140LIX9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cfap99A0A140LIX9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cfap99A0A140LIX9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cfap99A0A140LIX9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cfap99A0A140LIX9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cfap99A0A140LIX9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cfap99A0A140LIX9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cfap99A0A140LIX9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cfap99A0A140LIX9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cfap99A0A140LIX9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cfap99A0A140LIX9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Cfap99A0A140LIX9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Cfap99A0A140LIX9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cfap99A0A140LIX9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cfap99A0A140LIX9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cfap99A0A140LIX9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cfap99A0A140LIX9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cfap99A0A140LIX9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cfap99A0A140LIX9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cfap99A0A140LIX9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cfap99A0A140LIX9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cfap99A0A140LIX9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cfap99A0A140LIX9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cfap99A0A140LIX9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cfap99A0A140LIX9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cfap99A0A140LIX9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cfap99A0A140LIX9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cfap99A0A140LIX9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cfap99A0A140LIX9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cfap99A0A140LIX9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cfap99A0A140LIX9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cfap99A0A140LIX9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cfap99A0A140LIX9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cfap99A0A140LIX9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cfap99A0A140LIX9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cfap99A0A140LIX9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Cfap99A0A140LIX9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cfap99A0A140LIX9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cfap99A0A140LIX9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cfap99A0A140LIX9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cfap99A0A140LIX9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cfap99A0A140LIX9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cfap99A0A140LIX9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cfap99A0A140LIX9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cfap99A0A140LIX9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Cfap99A0A140LIX9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cfap99A0A140LIX9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cfap99A0A140LIX9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Cfap99A0A140LIX9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cfap99A0A140LIX9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cfap99A0A140LIX9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cfap99A0A140LIX9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cfap99A0A140LIX9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Cfap99A0A140LIX9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cfap99A0A140LIX9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cfap99A0A140LIX9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cfap99A0A140LIX9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cfap99A0A140LIX9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cfap99A0A140LIX9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cfap99A0A140LIX9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Cfap99A0A140LIX9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cfap99A0A140LIX9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cfap99A0A140LIX9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cfap99A0A140LIX9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cfap99A0A140LIX9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cfap99A0A140LIX9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cfap99A0A140LIX9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cfap99A0A140LIX9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cfap99A0A140LIX9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cfap99A0A140LIX9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cfap99A0A140LIX9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cfap99A0A140LIX9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cfap99A0A140LIX9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cfap99A0A140LIX9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cfap99A0A140LIX9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cfap99A0A140LIX9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cfap99A0A140LIX9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cfap99A0A140LIX9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cfap99A0A140LIX9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cfap99A0A140LIX9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cfap99A0A140LIX9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cfap99A0A140LIX9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cfap99A0A140LIX9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cfap99A0A140LIX9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cfap99A0A140LIX9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cfap99A0A140LIX9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
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