Protein–RNA interactions for Protein: A0A0M3U1B0

Sycp2l, Synaptonemal complex protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2lA0A0M3U1B0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sycp2lA0A0M3U1B0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sycp2lA0A0M3U1B0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sycp2lA0A0M3U1B0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Sycp2lA0A0M3U1B0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sycp2lA0A0M3U1B0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sycp2lA0A0M3U1B0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sycp2lA0A0M3U1B0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sycp2lA0A0M3U1B0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sycp2lA0A0M3U1B0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sycp2lA0A0M3U1B0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sycp2lA0A0M3U1B0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sycp2lA0A0M3U1B0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sycp2lA0A0M3U1B0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sycp2lA0A0M3U1B0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sycp2lA0A0M3U1B0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Sycp2lA0A0M3U1B0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sycp2lA0A0M3U1B0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sycp2lA0A0M3U1B0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sycp2lA0A0M3U1B0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sycp2lA0A0M3U1B0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sycp2lA0A0M3U1B0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sycp2lA0A0M3U1B0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sycp2lA0A0M3U1B0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sycp2lA0A0M3U1B0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sycp2lA0A0M3U1B0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sycp2lA0A0M3U1B0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sycp2lA0A0M3U1B0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sycp2lA0A0M3U1B0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sycp2lA0A0M3U1B0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sycp2lA0A0M3U1B0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sycp2lA0A0M3U1B0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sycp2lA0A0M3U1B0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sycp2lA0A0M3U1B0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sycp2lA0A0M3U1B0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sycp2lA0A0M3U1B0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sycp2lA0A0M3U1B0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sycp2lA0A0M3U1B0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sycp2lA0A0M3U1B0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sycp2lA0A0M3U1B0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sycp2lA0A0M3U1B0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sycp2lA0A0M3U1B0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sycp2lA0A0M3U1B0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sycp2lA0A0M3U1B0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sycp2lA0A0M3U1B0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sycp2lA0A0M3U1B0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sycp2lA0A0M3U1B0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Sycp2lA0A0M3U1B0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Sycp2lA0A0M3U1B0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sycp2lA0A0M3U1B0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sycp2lA0A0M3U1B0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sycp2lA0A0M3U1B0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sycp2lA0A0M3U1B0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sycp2lA0A0M3U1B0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sycp2lA0A0M3U1B0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sycp2lA0A0M3U1B0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sycp2lA0A0M3U1B0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms