Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXF1

Ighv3-4, Immunoglobulin heavy variable V3-4 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv3-4A0A0A6YXF1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ighv3-4A0A0A6YXF1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ighv3-4A0A0A6YXF1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ighv3-4A0A0A6YXF1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ighv3-4A0A0A6YXF1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ighv3-4A0A0A6YXF1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ighv3-4A0A0A6YXF1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ighv3-4A0A0A6YXF1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ighv3-4A0A0A6YXF1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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