Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Wdr54Q9R0D8 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Wdr54Q9R0D8 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Wdr54Q9R0D8 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Wdr54Q9R0D8 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Wdr54Q9R0D8 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Wdr54Q9R0D8 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Wdr54Q9R0D8 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Wdr54Q9R0D8 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Wdr54Q9R0D8 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Wdr54Q9R0D8 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Wdr54Q9R0D8 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Wdr54Q9R0D8 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Wdr54Q9R0D8 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Wdr54Q9R0D8 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Wdr54Q9R0D8 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Wdr54Q9R0D8 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Wdr54Q9R0D8 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Wdr54Q9R0D8 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Wdr54Q9R0D8 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Wdr54Q9R0D8 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Wdr54Q9R0D8 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Wdr54Q9R0D8 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Wdr54Q9R0D8 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Wdr54Q9R0D8 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Wdr54Q9R0D8 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Wdr54Q9R0D8 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Wdr54Q9R0D8 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Wdr54Q9R0D8 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Wdr54Q9R0D8 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Wdr54Q9R0D8 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Wdr54Q9R0D8 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Wdr54Q9R0D8 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Wdr54Q9R0D8 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Wdr54Q9R0D8 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Wdr54Q9R0D8 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Wdr54Q9R0D8 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Wdr54Q9R0D8 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Wdr54Q9R0D8 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Wdr54Q9R0D8 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Wdr54Q9R0D8 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Wdr54Q9R0D8 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Wdr54Q9R0D8 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Wdr54Q9R0D8 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Wdr54Q9R0D8 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Wdr54Q9R0D8 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Wdr54Q9R0D8 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Wdr54Q9R0D8 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Wdr54Q9R0D8 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Wdr54Q9R0D8 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Wdr54Q9R0D8 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Wdr54Q9R0D8 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Wdr54Q9R0D8 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Wdr54Q9R0D8 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Wdr54Q9R0D8 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Wdr54Q9R0D8 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Wdr54Q9R0D8 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Wdr54Q9R0D8 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Wdr54Q9R0D8 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Wdr54Q9R0D8 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms