Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Nek3Q9R0A5 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms