Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a3Q9QZS0 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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