Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM99

Prg4, Proteoglycan 4, mousemouse

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Length 1,054 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg4Q9JM99 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prg4Q9JM99 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prg4Q9JM99 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prg4Q9JM99 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prg4Q9JM99 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prg4Q9JM99 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prg4Q9JM99 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prg4Q9JM99 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prg4Q9JM99 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prg4Q9JM99 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prg4Q9JM99 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Prg4Q9JM99 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prg4Q9JM99 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prg4Q9JM99 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prg4Q9JM99 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Prg4Q9JM99 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prg4Q9JM99 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prg4Q9JM99 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prg4Q9JM99 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Prg4Q9JM99 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Prg4Q9JM99 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Prg4Q9JM99 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Prg4Q9JM99 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Prg4Q9JM99 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Prg4Q9JM99 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Prg4Q9JM99 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Prg4Q9JM99 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Prg4Q9JM99 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Prg4Q9JM99 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prg4Q9JM99 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Prg4Q9JM99 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prg4Q9JM99 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prg4Q9JM99 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prg4Q9JM99 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Prg4Q9JM99 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Prg4Q9JM99 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Prg4Q9JM99 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prg4Q9JM99 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prg4Q9JM99 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prg4Q9JM99 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prg4Q9JM99 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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