Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAT5

Trmu, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmuQ9DAT5 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrmuQ9DAT5 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms