Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q1

Ribc2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc2Q9D4Q1 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ribc2Q9D4Q1 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms