Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms