Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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MINDY3Q9CV28 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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MINDY3Q9CV28 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
MINDY3Q9CV28 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
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