Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms