Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Top1mtQ8R4U6 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Top1mtQ8R4U6 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Top1mtQ8R4U6 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Top1mtQ8R4U6 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Top1mtQ8R4U6 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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Top1mtQ8R4U6 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Top1mtQ8R4U6 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Top1mtQ8R4U6 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms