Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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