Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Pggt1bQ8BUY9 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Pggt1bQ8BUY9 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.4 ms