Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms